福建师范大学生物工程专业是国家级一流本科专业建设点、福建省一流本科专业，通过中国工程教育认证（CEEAA）并获《华盛顿协议》认证 。专业学制四年，授予工学学士学位 。
专业前身为1995年获批的“发酵工程”本科专业，1999年调整为现名。注重产学研结合与工程实践能力培养，在工业微生物发酵代谢调控等领域具有特色 。学生毕业后可在制药、食品等相关领域就业或继续深造 。
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