2026年3月5日，自称由日本前警察和前自卫队队员组成的组织向使馆寄出恐吓信，威胁称将对中国驻日使领馆发动袭击，19天后，现役自卫队官员村田晃大持刀翻墙闯入中国使馆，中方紧急向日本外务省、警方提出严正交涉。3月31日，又一名自称应急预备自卫官的人通过网络向使馆发出恐怖威胁，称其在中国使馆内安装了远距离遥控炸弹 。使馆立即向警方报警，日本警方当天对使馆展开了近两个小时的排弹作业。
2026年4月16日消息，日本警方未给予重视，未采取有力措施，至今没有查明事实真相。
2026年4月22日，针对近期日本接连发生以中国驻日本大使馆为目标的恐怖威胁，朝鲜劳动党机关报《劳动新闻》刊发评论文章，对日本进行谴责 。6月17日消息，有日本民众自发集会，对高市早苗涉台发言及自卫队员闯中国使馆事件表达不满和歉意，他们还呼吁日本政府正式向中方道歉。
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