《地下交通站》有两部，第一部和第二部结局不同。
第一部（《地下交通站》）结局：黑藤规三被野尻正川、改邪归正的卧底白翻译以及黄金标联合设计。贾贵叛变未遂，其反间计也被识破。最终，由于野尻的愚蠢操作，黑藤被送进北平疯人病院。剧情在20集完整版（删减版18集）中快速收尾，第一部核心角色结局集中于反派覆灭。
第二部（《二号交通站》）结局：黑藤被放出疯人院，野尻买通关系返回，鼎香楼改为停尸房，众人重聚驴驹桥。黑藤利用新角色石原离间野尻，使得野尻被送上军事法庭，不过黑藤再次被陷害入狱。第二部口碑较差，剧情与第一部差异大，原班人马减少，因风格突变和剧情弱化，评价较低。
