《异形殖民军》中的武器系统还原了电影中的经典装备，以下为具体介绍：
M41A2脉冲步枪：这是《异形》系列电影中的标志性武器之一，在《异形殖民军》游戏设定中，它同样是殖民陆战队对抗异形生物的重要装备。该步枪具备全自动火力，其显著特点在于海军陆战队对其的戏称——专家标志是能扣扳机只射出一发子弹，这既体现了其火力之猛，也暗示了操作上的难度。M41A2脉冲步枪采用无壳弹药设计，这一创新使得它在EVA（舱外活动）和微重力环境下使用时，无需担心灼热的漂浮黄铜弹壳可能灼伤友军的问题，极大地提高了作战的安全性和效率。
火焰喷射器：在《异形殖民军》中，火焰喷射器作为一种军事化火焰喷射单位，其原型改造自民用土木建设设备。这种改造不仅体现了军事技术的灵活应用，也反映了在面对外来侵略性物种入侵时，人类军队的快速适应和创新能力。火焰喷射器在镇压异形生物等外来侵略者时发挥了重要作用，其强大的火焰攻击能够迅速消灭或驱散敌人，为陆战队提供有效的火力支援。
M56智能枪：作为《异形2》中登场的高科技未来武器，M56智能枪在《异形殖民军》游戏中也得到了还原。它是殖民地海军陆战队配备的标准制式武器，是一种个人携行用的无弹壳机枪。M56智能枪的名字由来是其内建了微电脑控制的动态自动追踪瞄准与稳定系统，这一系统使得使用者只需搭配M56战斗控制背带附属的战术观测镜，就能操控智能枪自动精准地瞄准、射击任何持枪者所见的目标。这种高科技武器的引入，不仅提高了陆战队的作战能力，也体现了未来战争中科技与武器的紧密结合。
