《空之境界》剧场版正确观看顺序为：《杀人考察（前）》、《珈蓝之洞》、《痛觉残留》、《俯瞰风景》、《矛盾螺旋》、《忘却录音》、《杀人考察（后）》、《终章》，外传可单独观看。
《杀人考察（前）》
故事起始于1995年即将升上高中前的雪夜，黑桐干也看到没撑伞、穿和服的少女两仪式。春天开学典礼两人再次相遇，逐渐成为朋友，干也开始直呼式的名字。这一部主要展现两人相识相知的过程，为后续故事奠定情感基础，让观众了解两人关系的起始状态。
《珈蓝之洞》
意外事故后，两仪式持续昏睡两年，期间一直触摸“死”并对其产生畏惧。最终“死”觉醒，她失去了在同一容器中的碎片“织”。这一部聚焦于两仪式自身意识层面的变化，是故事发展的重要转折，使两仪式的人物设定更加复杂和立体，引出后续她面对各种事件时的不同表现。
《痛觉残留》
出现了行踪不明的后辈、无法相遇的妹妹与友人，以及因切割惨死的尸体不断增加的情况。夏天下雨之夜，能将全部歪曲破坏的少女与能看见全部死线的少女充满杀意地对峙。此部进一步推进剧情，展现了两仪式周围危险的环境和紧张的氛围，让观众感受到故事逐渐走向高潮。
《俯瞰风景》
初夏，黑桐干也每天带慰劳品去两仪式家中，同时发生一连串少女跳楼自杀事件，巫条大楼顶楼出现浮游少女。这一部将故事场景拓展到更广泛的社会层面，通过少女自杀事件引发观众对背后原因的好奇，同时也让两仪式和黑桐干也被卷入其中，推动剧情发展。
《矛盾螺旋》
他们的遭遇引发关于偶然与必然的思考，正如橙子所说，看似偶然的事情背后隐藏着未知的法则，众人渐渐显现出道路的去向并开始前进。这一部深入探讨了故事中的一些哲学概念和人物命运的走向，使剧情更加富有深度和内涵，为后续的结局埋下伏笔。
《忘却录音》
由妖精引发事件，伽蓝之堂接到发生在礼园女学院的委托，委托交给黑桐干也的妹妹鲜花处理。这一部引入新的场景和人物，丰富了故事的背景和情节，同时也从侧面展现了不同人物在面对事件时的不同态度和处理方式。
《杀人考察（后）》
街上因连续杀人事件人心惶惶，黑桐干也与两仪式看似过着平常日子，但当看到电视报导“三年前的杀人魔是否又出现了”的消息后，式开始紧绷。时间回溯到三年前冬天，式体内存在自称“自己是杀人凶手”的另一个人格“织”。这一部将前面的伏笔进行回收，揭示了式与杀人事件之间的复杂关系，是故事的重要高潮部分。
《终章》
回顾1995年与两仪式相遇、1996年她陷入沉眠、1998年苏醒后的情况，同时提到想得到她的意图蠢蠢欲动，1999年命运齿轮偏离轨道，再次出现恶魔杀人事件，式内心的杀人冲动和“织”无迹可寻。这一部对整个故事进行总结和收尾，将前面的情节串联起来，给观众一个完整的结局。
外传
外传故事相对独立，讲述了1998年夏天两仪式卷入炸弹爆发案以及礼园女学院学生濑尾静音与黑桐干也相遇等情节。观众可以在看完主线剧情后，通过外传进一步了解故事中的世界和人物。
